پیکسل 6 و پیکسل 6 پرو ویژگی‌های زیادی دارند که می‌توان آن‌ها را تحسین کرد؛ اما اسکنر اثر انگشت موجود روی آن‌ها جزو این موارد نیست. از زمان عرضه این گوشی کاربران زیادی از عملکرد کند و ضعیف سنسور اسکنر اثر انگشت پیکسل 6 و پیکسل 6 پرو شکایت داشته‌‌اند. حالا گوگل به این شکایات پاسخ داده است؛ پاسخی که به هیچ وجه قانع کننده نیست.
گوگل در این پاسخ از مشکلات به وجود آمده عذرخواهی و اعلام کرده است که اسکنر اثرانگشت سری پیکسل 6 گوگل از الگورتیم‌های امنیتی پیشرفته‌ای استفاده می‌کند. در برخی مواقع این لایه‌های حفاظتی افزوده شده موجب می‌شود که تایید اثر انگشت بیشتر طول بکشد و نیاز به زمان بیشتری برای شناسایی اثر انگشت باشد.
همان‌طور که مشخص است جواب گوگل برای این شکایات چندان قانع کننده نیست. البته گوگل در انتهای این اطلاعیه اعلام می‌کند که کاربران از تمیز بودن انگشت خود اطمینان حاص کنند!
کاربرانی که با این ایراد درگیر هستند معتقدند که این مشکل احتمالا سخت‌افزاری است. پیکسل 6 از اسکنر اثر انگشت اپتیکال زیر نمایشگر استفاده می‌کند، این در حالی است که در یک پرچم‌دار هم‌چون گلکسی S21 از سنسور اولتراسونیک استفاده شده است. با این حال این موضوع نیز نمی‌تواند دلیل خوبی باشد، زیرا در گوشی‌های وان پلاس نیز از سنسور اپتیکال استفاده می‌شود اما کاربران با مشکلی مشابه پیکسل 6 مواجه نیستند. از این رو ممکن است ایراد پرچم‌داران گوگل نرم‌افزاری باشد.
در حال حاضر هیچ راه حلی برای رفع مشکل اسکنر اثر انگشت گوگل پیکسل 6 وجود ندارد و پاسخ گوگل نیز کاملا مبهم است. بنابراین نمی‌توان گفت که آیا گوگل می‌تواند این مشکل را با انتشار یک آپدیت برطرف کند یا خیر. به این ترتیب تا زمانی که گوگل سیستم تشخیص چهره خود را که آن هم با ایراداتی مواجه بود را فعال نکند، کاربران تنها می‌توانند با تایپ کردن پین کد قفل گوشی خود را باز کنند.